Süper Lig'in eski takımlarından olan ve bu sezon yer aldığı 3.Lig 3.Grup'taki karşılaşmalarına çıkmayan Yeni Malatyaspor, Türkiye Futbol Federasyonu Profesyonel Futbol Disiplin Kurulu'nun (PFDK) kararıyla amatör lige düşürüldü.2017-18 sezonunda Süper Lig'de yükselen ve Yeni Malatyaspor, bir sonraki sezonu 5. sırada tamamlamış ve Türkiye Kupası'nı lig şampiyonu Galatasaray'ın kazanmasıyla Avrupa Ligi'ne gitmeye hak kazanmıştı.
Malatya temsilcisi, 2020-2021 sezonunu 15. sırada tamamlarken, 2021-2022 sezonunu ise son sırada bitirerek Süper Lig'den düşmüştü.
Yaşanan bu düşüşten sonra kulüp mali olarak toparlanamadı an itibarıyla 19 yıllık profesyonel hayatı sona erdi.